Analogicznie, gdy w urzędzie przeznaczenia będzie dokonywany częściowy rozładunek, operacja tranzytowa NCTS zostanie zakończona. Dla pozostałych towarów będzie wymagane nowe zgłoszenie elektroniczne TIR, w którym należy podać numer MRN poprzedniej operacji NCTS, i otwarta zostanie nowa operacja NCTS do kolejnego urzędu przeznaczenia.
A zatem, na przykład, jeżeli przewóz TIR rozpocznie się w Hamburgu, należy tam otworzyć operację tranzytową NCTS (przesłać zgłoszenie elektroniczne do systemu niemieckiego). Jeżeli będzie miał miejsce doładunek towarów w Warszawie, dla wszystkich towarów będzie wymagane kolejne zgłoszenie elektroniczne przesłane do polskiego systemu NCTS.
Jeżeli zgłoszenie TIR nie zostanie przesłane elektroniczne, nie będzie możliwe otwarcie operacji tranzytowej TIR.
gdy nie ma możliwości korzystania z systemu NCTS z powodu jego awarii – wtedy procedura TIR realizowana będzie wyłącznie na podstawie karnetu TIR.
Istnieje kilka możliwości przesyłania zgłoszeń elektronicznych TIR do systemu NCTS w Polsce:
Wprowadzenie elektronicznej obsługi procedury TIR w systemie NCTS przyniesie istotne korzyści, także przedsiębiorcom korzystającym z tej procedury: