Karnet gwarancyjny może zostać zastosowany do procedury tranzytu jako dokument tranzytowy. Musi dotyczyć towarów, których miejsce wysyłki lub przeznaczenia znajduje się poza polskim obszarem celnym. kwestie stosowania karnetu ATA reguluje w sposób szczegółowy Konwencja celna w sprawie karnetu ATA dla odprawy warunkowej towarów (konwencja ATA sporządzona w Brukseli dnia 6 grudnia 1961r. – Dz.U. z 1969r. Nr 30, poz. 242, 243)